精密噪聲測試頻譜分析儀一般只有一個射頻輸入端。這不同于示波器多通道輸入,可以用來比較通道之間的波形差異;頻譜分析儀普遍基于掃描的動態測量過程,顯示的譜線并不是實時的,雖然很多頻譜分析儀提供了外部觸發或視頻觸發的功能,但更多是一種同步功能,主要并不是用來觸發比較的。
精密噪聲測試頻譜分析儀射頻輸入端的輸入阻抗通常為50或75歐姆,從而可以直接與大多數射頻和微波設備的50歐系統相匹配,并通過線纜直連,一般是沒有探頭的,因為探頭需要很高的輸入阻抗,例如電路的探測往往需要高阻抗,而50歐姆難以帶動這類負載,使得測量結果嚴重偏小。有一些高輸入阻抗放大器具有50歐姆輸出阻抗,這種放大器構成的有源探頭有助于實現這類測量并維持高靈敏度。在有些頻譜分析儀的射頻輸入端的旁邊,常會提供有源探頭的供電口(ProbePower)。
通常精密噪聲測試頻譜分析儀的測量范圍不是從直流開始,低頻測試的限制是射頻輸入口的耦合結構。大部分頻譜儀應用了積分耦合電容來保護混頻器,防止外部灌入直流能量,這個電容抬升了低端測量的頻率,大部分頻譜分析儀的起始測量頻率僅能從9kHz開始。